Funktsionaalsed toidud võib liigitada nelja põhikategooriasse, millest igaühel on oma ainulaadsed omadused ja tervist edendavad omadused.
1. Traditsioonilised funktsionaalsed toidud
Need on toidud, mida on erinevates kultuurides sajandeid tunnustatud nende tervisele kasulike omaduste poolest. Näiteks kuuluvad sellesse kategooriasse täisteratooted, nagu pruun riis, kaer ja oder. Need on rikkad kiudainete, vitamiinide ja mineraalainete poolest. Täisteratoodetes sisalduvad kiudained aitavad seedimist, soodustavad küllastumist ja võivad aidata kaasa veresuhkru paremale kontrollile. Teine traditsiooniline funktsionaalne toit on roheline tee. See sisaldab polüfenoole, eriti katehhiine, millel on antioksüdantsed omadused. Rohelist teed on seostatud erinevate haiguste, sealhulgas südamehaiguste ja teatud tüüpi vähiriski vähenemisega. Aasia kultuurides on seda juba pikka aega tarbitud selle võimaliku tervist parandava toime tõttu.
2. Modifitseeritud funktsionaalsed toidud
Need on traditsioonilised toidud, mida on nende funktsionaalsete omaduste parandamiseks muudetud. Üks levinud näide on rikastatud toidud. Tugevdatud hommikusöögihelvestele on sageli lisatud vitamiine ja mineraalaineid nagu raud, foolhape ja erinevad B-vitamiinid. See on eriti kasulik, kuna aitab inimestel täita oma igapäevaseid toitumisvajadusi, eriti neil, kellel võib esineda puudusi. Teine näide on madala rasvasisaldusega piimatooted. Vähendades rasvasisaldust ja mõnikord lisades probiootikume, pakuvad need tooted piimatoodete (nt kaltsiumi) eeliseid, olles samal ajal südamele tervislikumad ja soolesõbralikumad. Modifitseeritud funktsionaalsed toidud mängivad olulist rolli erinevate elanikkonnarühmade spetsiifiliste toitumisvajaduste rahuldamisel.
3. Meditsiinilised toidud
Meditsiinilised toidud on mõeldud kasutamiseks arsti järelevalve all, et ravida konkreetseid haigusseisundeid. Näiteks on enteraalseid toitumistooteid, mis on mõeldud malabsorptsioonihäiretega patsientidele või neile, kes ei saa suu kaudu toitu tarbida. Need tooted on hoolikalt koostatud, et pakkuda vajalikke toitaineid kujul, mida patsient talub ja omastab. Teine näide on diabeetikutele mõeldud toidud. Neil on konkreetne glükeemiline indeks ja toitainete koostis, mis aitavad tõhusalt reguleerida veresuhkru taset. Ravitoidud on kõrgelt spetsialiseerunud ja kohandatud vastama konkreetsete haigusseisunditega patsientide ainulaadsetele vajadustele.
4. Uued funktsionaalsed toidud
Need on suhteliselt uut tüüpi funktsionaalsed toidud, mis on sageli teadusuuringute ja tehnoloogiliste edusammude tulemus. Üks näide on bioaktiivseid peptiide sisaldavad toidud. Nendel peptiididel võivad olla erinevad funktsioonid, näiteks vererõhu alandamine või immuunfunktsiooni parandamine. Teine näide on funktsionaalsed toidud, millele on lisatud fütosteroole. Fütosteroolid võivad aidata vähendada kolesterooli imendumist soolestikus, avaldades seeläbi positiivset mõju südame tervisele. Uued funktsionaalsed toidud pakuvad põnevaid võimalusi tervise parandamiseks ja haiguste ennetamiseks uuenduslike toidukoostiste kaudu.

